More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4887 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
397 aa  777    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  71.39 
 
 
393 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  70 
 
 
391 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.12 
 
 
402 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.9 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.9 
 
 
393 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.9 
 
 
393 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.9 
 
 
393 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.9 
 
 
393 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.62 
 
 
393 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.23 
 
 
400 aa  292  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  46.02 
 
 
393 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  43.5 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  42.3 
 
 
396 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  47.24 
 
 
393 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  38.38 
 
 
373 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  55.56 
 
 
251 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  41.73 
 
 
389 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  40.66 
 
 
396 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  40.78 
 
 
397 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  42.37 
 
 
386 aa  226  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  40.37 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  46.67 
 
 
263 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  43.7 
 
 
261 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  46.59 
 
 
260 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4075  alpha/beta hydrolase fold  43.03 
 
 
272 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  42.63 
 
 
259 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  71.43 
 
 
128 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  39.84 
 
 
259 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  40.32 
 
 
256 aa  172  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  43.37 
 
 
265 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  71.9 
 
 
132 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  41.41 
 
 
260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  69.67 
 
 
132 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  39.13 
 
 
256 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  39.13 
 
 
256 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  39.13 
 
 
256 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  68.03 
 
 
132 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.2 
 
 
128 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  42 
 
 
265 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.4 
 
 
128 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.11 
 
 
128 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
128 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
128 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  67.5 
 
 
131 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.2 
 
 
128 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.84 
 
 
129 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.2 
 
 
128 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.2 
 
 
128 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.2 
 
 
128 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
128 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
129 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
129 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
129 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.48 
 
 
128 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  62.3 
 
 
130 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  58.2 
 
 
133 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.48 
 
 
128 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.3 
 
 
131 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  41.02 
 
 
272 aa  156  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 
256 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  56.43 
 
 
161 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  37.7 
 
 
269 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  56.56 
 
 
133 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  40.59 
 
 
263 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.2 
 
 
130 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  56.56 
 
 
132 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.74 
 
 
130 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.74 
 
 
130 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.74 
 
 
130 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 
263 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  64.91 
 
 
134 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  38.4 
 
 
261 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  57.98 
 
 
132 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  39.24 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.14 
 
 
132 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  36.05 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.74 
 
 
154 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  65.25 
 
 
122 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  34.4 
 
 
261 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  39.33 
 
 
263 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  64.96 
 
 
137 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  37.9 
 
 
258 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  37.4 
 
 
262 aa  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  36.82 
 
 
263 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  39.33 
 
 
263 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.91 
 
 
133 aa  146  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  38.02 
 
 
262 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  36.82 
 
 
263 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.1 
 
 
130 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2282  Carboxymuconolactone decarboxylase  69.37 
 
 
114 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175309  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  42.86 
 
 
266 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.68 
 
 
129 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  39.08 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  42.45 
 
 
266 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  36.51 
 
 
263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.61 
 
 
261 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  39.51 
 
 
261 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  39.09 
 
 
261 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  39.51 
 
 
261 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>