More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5083 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5083  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.501475  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5171  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5461  diacylglycerol O-acyltransferase  98.5 
 
 
753 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2791  alpha/beta hydrolase fold  46.95 
 
 
316 aa  232  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1163  alpha/beta hydrolase fold protein  45.11 
 
 
296 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  28.27 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.43 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 
263 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.37 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  29.01 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  26.79 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.05 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.89 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25.61 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  29.74 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  31 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  26.27 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
368 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  28.02 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.15 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  26.74 
 
 
263 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.2 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
259 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.41 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.39 
 
 
425 aa  62.4  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 
256 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.79 
 
 
283 aa  62.4  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.43 
 
 
392 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.74 
 
 
396 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.74 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  29.36 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
264 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  26.24 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
300 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
254 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
266 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 
363 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  41.57 
 
 
250 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
262 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 
263 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.66 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  24.14 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  27.39 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  27.73 
 
 
282 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  24.71 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  24.71 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
262 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  27.4 
 
 
272 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  24.71 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 
322 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
263 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 
255 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  29.26 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
276 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 
263 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
271 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
258 aa  55.8  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  30.51 
 
 
396 aa  55.8  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
254 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  22.54 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  25.4 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  32.85 
 
 
514 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  27.59 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  24.71 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
339 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>