More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2123 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 276 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  98.55 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  96.01 
 
 		 276 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  84 
 
 		 277 aa  480  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  78.1 
 
 		 276 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  78.47 
 
 		 276 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  77.01 
 
 		 276 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  77.37 
 
 		 276 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  74.18 
 
 		 280 aa  434  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  63.41 
 
 		 278 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  60.14 
 
 		 277 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  64.94 
 
 		 284 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  59.85 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  61.45 
 
 		 275 aa  348  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  58.21 
 
 		 271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  58.21 
 
 		 275 aa  335  7e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  57.58 
 
 		 270 aa  318  3.9999999999999996e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  47.91 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  47.91 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  49.81 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 282 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  46.77 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  45.35 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  46.82 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  47.17 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  45.35 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  45.35 
 
 		 271 aa  225  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  43.87 
 
 		 328 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.87 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  43.87 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.87 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.87 
 
 		 328 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  42.48 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  45.61 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 270 aa  185  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.55 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.82 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.2 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 276 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  25.93 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.35 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.43 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  28.06 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.27 
 
 		 425 aa  88.6  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.34 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.6 
 
 		 259 aa  86.3  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.8 
 
 		 248 aa  85.9  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.51 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.21 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  25.64 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  27.09 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.9 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  24.5 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  27.21 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  26.98 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  24.1 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  24.1 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  27.54 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  25.35 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.55 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  26.02 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>