More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3257 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  45.09 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  27.87 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  26.27 
 
 		 311 aa  85.1  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  29.08 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  24.7 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  27.71 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  25.93 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  26.75 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  22.98 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  24.08 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  27.53 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  41.98 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  33.77 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  34.56 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  25.27 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  26.69 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  25.81 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.61 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  22.61 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  40.46 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  25.93 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  25.94 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  25.94 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  25.94 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  25.94 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  23.92 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  45.54 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  22.92 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.22 
 
 		 270 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 571 aa  72  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  41.35 
 
 		 258 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  22.22 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  23.6 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0341  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  27.73 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  22.22 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  25.93 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.48 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  22.92 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.29 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  26.03 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  34.4 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.99 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  40.48 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  26.17 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  25.52 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  38.17 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  22.67 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  36.5 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  25.98 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>