More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4474 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
261 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
261 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
261 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  96.55 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  96.93 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  96.93 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  92.72 
 
 
261 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  84.29 
 
 
261 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  84.29 
 
 
261 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  84.29 
 
 
261 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  84.29 
 
 
261 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  84.29 
 
 
261 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  84.29 
 
 
261 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  83.52 
 
 
261 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  65 
 
 
263 aa  358  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  64.23 
 
 
263 aa  355  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  63.71 
 
 
263 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  51.35 
 
 
259 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  49.6 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  49.41 
 
 
263 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  48.65 
 
 
392 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  44.62 
 
 
270 aa  235  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  48.48 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  43.08 
 
 
270 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  43.08 
 
 
270 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  47.29 
 
 
262 aa  231  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  44.62 
 
 
260 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  47.24 
 
 
269 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  46.54 
 
 
396 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  48.82 
 
 
263 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  45.08 
 
 
263 aa  224  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  43.46 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  46.85 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  48.09 
 
 
263 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  47.24 
 
 
263 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  46.85 
 
 
263 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  44.44 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  45.31 
 
 
360 aa  209  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  44.66 
 
 
262 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  42.69 
 
 
261 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  44.92 
 
 
377 aa  208  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  42.86 
 
 
255 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  40.15 
 
 
260 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  43.89 
 
 
265 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  46.95 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  41.83 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  41.54 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  42.25 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  42.25 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  40.15 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  41.8 
 
 
261 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  43.85 
 
 
268 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  45.53 
 
 
266 aa  192  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  45.14 
 
 
266 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 
373 aa  188  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  45.16 
 
 
253 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  41.25 
 
 
265 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  41.54 
 
 
265 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  41.38 
 
 
267 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  42.17 
 
 
263 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  42.41 
 
 
259 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  42.53 
 
 
265 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  40.74 
 
 
256 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  40.74 
 
 
256 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  40.74 
 
 
256 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  41.15 
 
 
268 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  39.38 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  43.51 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  40.61 
 
 
263 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  39.62 
 
 
262 aa  178  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  39.23 
 
 
396 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  37.74 
 
 
282 aa  174  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
279 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  36.58 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  37.55 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 
263 aa  172  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  38.08 
 
 
265 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  41.92 
 
 
393 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  41.67 
 
 
251 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  41.49 
 
 
262 aa  168  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  39.09 
 
 
266 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  36.69 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  36.47 
 
 
282 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  38.89 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  37.69 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  42.51 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  37.02 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  36.68 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1118  3-oxoadipate enol-lactonase  43.07 
 
 
266 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  38.17 
 
 
256 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
262 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  37.55 
 
 
263 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  35.38 
 
 
397 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  36.58 
 
 
266 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 
260 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  38.87 
 
 
390 aa  155  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  37.07 
 
 
386 aa  155  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  35 
 
 
263 aa  154  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>