More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5507 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
269 aa  550  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  76.23 
 
 
275 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  71.71 
 
 
275 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  72.55 
 
 
280 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  45.56 
 
 
259 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  36.76 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  38.15 
 
 
277 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  37.05 
 
 
282 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 
277 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 
277 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 
282 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  36.99 
 
 
292 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  31.42 
 
 
282 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  35 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.68 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
279 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  34.48 
 
 
259 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  31.8 
 
 
262 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  32.68 
 
 
263 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  32.19 
 
 
259 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  32.06 
 
 
260 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.06 
 
 
260 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
262 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  35.63 
 
 
246 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  31.23 
 
 
373 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
272 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 
281 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
282 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.09 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  34.88 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
279 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  31.32 
 
 
278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 
262 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
263 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  29.18 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.61 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  33.98 
 
 
386 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  32.43 
 
 
263 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 
266 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  30.04 
 
 
260 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  30.27 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  30.38 
 
 
380 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.65 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.11 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  31.52 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  31.13 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 
397 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  33.08 
 
 
263 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.85 
 
 
268 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.01 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  30.94 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  30.94 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  30.94 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  31.85 
 
 
397 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 
261 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 
262 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.57 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
265 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  33.2 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 
263 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.96 
 
 
261 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  30.19 
 
 
261 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  29.59 
 
 
264 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
346 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  30.93 
 
 
261 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
256 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
271 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 
256 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  30.57 
 
 
261 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  30.57 
 
 
261 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  29.81 
 
 
261 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  30.57 
 
 
261 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  30.57 
 
 
261 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
261 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.76 
 
 
260 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
261 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  30.57 
 
 
261 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 
261 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 
260 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
281 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  29.76 
 
 
393 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
277 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29 
 
 
267 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
266 aa  105  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
258 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
260 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>