More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4238 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  88.55 
 
 
262 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  70.61 
 
 
262 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  42.47 
 
 
282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  43.41 
 
 
279 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  43.41 
 
 
279 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  42.8 
 
 
279 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  43.51 
 
 
282 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  37.45 
 
 
260 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  37.45 
 
 
260 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  41.15 
 
 
265 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  39.69 
 
 
360 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  38.37 
 
 
265 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  35.94 
 
 
271 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  37.01 
 
 
269 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  41.77 
 
 
425 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  35.8 
 
 
263 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  36.47 
 
 
259 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 
256 aa  175  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  36.92 
 
 
263 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  38.4 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.21 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  38.59 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  37.25 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  41.31 
 
 
393 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  35.41 
 
 
263 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  36.36 
 
 
263 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  38.15 
 
 
260 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  35.55 
 
 
260 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  35.02 
 
 
258 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  36.51 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  36.43 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  36.43 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.43 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  36.43 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  36.43 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  36.43 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  34.38 
 
 
261 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  36.48 
 
 
270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  36.48 
 
 
270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  36.95 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  35.55 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  39.36 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  36.19 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  38.17 
 
 
377 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  41.13 
 
 
386 aa  162  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  41.22 
 
 
393 aa  161  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  37.5 
 
 
270 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  37.05 
 
 
263 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  37.04 
 
 
259 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  35.8 
 
 
261 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  35.04 
 
 
256 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  35.8 
 
 
261 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  35.83 
 
 
263 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  35.8 
 
 
261 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  35.04 
 
 
256 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  35.04 
 
 
256 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  37.35 
 
 
261 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  33.98 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  34.66 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  35.57 
 
 
262 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  34.63 
 
 
261 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  34.63 
 
 
261 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  34.63 
 
 
261 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  35.57 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  35.48 
 
 
255 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  36.61 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  35.8 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  36 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  34.52 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  37.35 
 
 
263 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  34.29 
 
 
263 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  36.86 
 
 
265 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
275 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  36.47 
 
 
265 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  30.65 
 
 
373 aa  148  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
263 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  35.83 
 
 
263 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  34.66 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  38.15 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  34.26 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  34.85 
 
 
262 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  36.02 
 
 
266 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  32.56 
 
 
269 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 
268 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  35.43 
 
 
392 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  36.4 
 
 
266 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  34.23 
 
 
267 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  33.98 
 
 
396 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  33.86 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 
259 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  37.34 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  34.12 
 
 
262 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 
260 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  35.57 
 
 
263 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1118  3-oxoadipate enol-lactonase  40.86 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>