More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3645 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 292 aa  593  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  99.64 
 
 		 277 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  97.11 
 
 		 277 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  95.31 
 
 		 277 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  74.01 
 
 		 277 aa  407  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  76.9 
 
 		 277 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  71.63 
 
 		 282 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  73.86 
 
 		 282 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  45.56 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  37.26 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 280 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 		 269 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  40.41 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  38.55 
 
 		 249 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  33.46 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  36.36 
 
 		 425 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  34.54 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  34.26 
 
 		 282 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  31.6 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  32.4 
 
 		 279 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  33.73 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  32.9 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  32.83 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  34.02 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 270 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  34.44 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.93 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  31.95 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  29.66 
 
 		 380 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.52 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.52 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  34.02 
 
 		 261 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  34.02 
 
 		 261 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  34.02 
 
 		 261 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.88 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.38 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  32.78 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  34.39 
 
 		 265 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  30.68 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.42 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  35.6 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.14 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.2 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.98 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  33.74 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  35.74 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  31.54 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  34.01 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.2 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.46 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  31.87 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  35.34 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  32.14 
 
 		 397 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  32.93 
 
 		 262 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  35.37 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  33.33 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.08 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 262 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 		 254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  32.79 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  32.79 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  30.99 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 		 263 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  30.49 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  27.97 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>