More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00853 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  568  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  87.82 
 
 		 271 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  66.67 
 
 		 270 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  58.82 
 
 		 277 aa  350  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 		 276 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  59.62 
 
 		 276 aa  344  7e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  58.36 
 
 		 276 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  59.25 
 
 		 276 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  58.18 
 
 		 277 aa  337  9e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  58.21 
 
 		 276 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  58.8 
 
 		 278 aa  333  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  57.84 
 
 		 276 aa  332  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  57.84 
 
 		 276 aa  332  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  57.3 
 
 		 276 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  55.64 
 
 		 280 aa  323  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  57.25 
 
 		 284 aa  318  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  53.76 
 
 		 275 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  47.06 
 
 		 271 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  45.99 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  46.35 
 
 		 372 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  46.35 
 
 		 328 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  46.32 
 
 		 273 aa  240  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  46.32 
 
 		 273 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  46.72 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  46.84 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  46.84 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  46.35 
 
 		 274 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  46.3 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  45.52 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  46.1 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  46.04 
 
 		 274 aa  234  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  45.72 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  48.32 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  41.15 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  31.64 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  30.83 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  31.88 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  30.22 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.81 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  29.32 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  29.21 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.18 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.16 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  28.08 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.4 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.74 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  29.3 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  28.11 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 263 aa  95.5  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.01 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.59 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  29.28 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  31.85 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 271 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 393 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.12 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>