More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2317 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 270 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  43.82 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  43.82 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  43.07 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.07 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  43.07 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  43.07 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.07 
 
 		 328 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.07 
 
 		 372 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  43.07 
 
 		 274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  43.07 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  42.7 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  41.95 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  41.95 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  43.13 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 		 274 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  41.42 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  40.45 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  41.63 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  38.78 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  41.63 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  41.25 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 		 270 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 276 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  41.88 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 		 265 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.63 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.23 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  34.59 
 
 		 392 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.95 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.34 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.94 
 
 		 370 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.44 
 
 		 248 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.96 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 		 263 aa  88.6  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  31.58 
 
 		 396 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31.56 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  31.48 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.84 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  32.92 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 273 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.15 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  33.05 
 
 		 261 aa  85.5  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.6 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  25.75 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.55 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  26.64 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.76 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  29.01 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.87 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>