More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0572 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
266 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  59.09 
 
 
266 aa  331  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  61.39 
 
 
264 aa  322  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  58.69 
 
 
265 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  57.58 
 
 
266 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  58.4 
 
 
280 aa  308  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
265 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  37.69 
 
 
283 aa  184  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  39.15 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  32.82 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  38.82 
 
 
255 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
263 aa  158  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
264 aa  155  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  36.08 
 
 
264 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 
264 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 
263 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 
263 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  38.37 
 
 
263 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  38.04 
 
 
265 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  36.98 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  36.65 
 
 
263 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
262 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 
265 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
263 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  36.1 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  34.02 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 
248 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
300 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
258 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.88 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
263 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
279 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
279 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
279 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  31.54 
 
 
262 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  33.62 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
273 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  32.2 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  31.37 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
278 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 
286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.43 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  33.46 
 
 
278 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
270 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  32.52 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  32.71 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  32.71 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
281 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  30.15 
 
 
277 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  32.71 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  32.71 
 
 
278 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
273 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  33.33 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  35.89 
 
 
248 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  32.34 
 
 
278 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  30.22 
 
 
275 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 
277 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
297 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 
270 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 
309 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
276 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
279 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  34.77 
 
 
292 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  29.48 
 
 
272 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
279 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
274 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
305 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 
297 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
270 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
278 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  31.48 
 
 
273 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
231 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
261 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
274 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  30.6 
 
 
277 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
274 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  29.52 
 
 
273 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
270 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
270 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
273 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.23 
 
 
259 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 
261 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
271 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
277 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  32.09 
 
 
275 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
270 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
275 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 
278 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
277 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>