More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4478 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
272 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  90.37 
 
 
272 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  80.74 
 
 
272 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  83.33 
 
 
272 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  80.07 
 
 
272 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  80.07 
 
 
272 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  74.17 
 
 
272 aa  431  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  69.6 
 
 
273 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  58.46 
 
 
334 aa  336  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  58.61 
 
 
273 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  58.46 
 
 
273 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  58.46 
 
 
273 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  56.46 
 
 
273 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  55.68 
 
 
273 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  54.95 
 
 
273 aa  322  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  55.88 
 
 
273 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  55.15 
 
 
273 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  55.15 
 
 
274 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  56.46 
 
 
273 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  54.78 
 
 
273 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 
273 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  54.78 
 
 
273 aa  316  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  57.35 
 
 
273 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  54.41 
 
 
290 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  53.31 
 
 
273 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  53.87 
 
 
274 aa  312  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  56.41 
 
 
274 aa  311  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 
277 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 
277 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 
277 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  51.84 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  55.47 
 
 
317 aa  305  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  55.68 
 
 
277 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  54.21 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  52.75 
 
 
273 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  52.38 
 
 
274 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  50.74 
 
 
280 aa  300  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  52.63 
 
 
276 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  52.77 
 
 
322 aa  298  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  51.28 
 
 
273 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  52.42 
 
 
322 aa  298  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  51.85 
 
 
273 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  53.01 
 
 
330 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  51.1 
 
 
273 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  50.74 
 
 
273 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  49.64 
 
 
275 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 
273 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  52.04 
 
 
340 aa  291  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  52.06 
 
 
297 aa  290  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
275 aa  288  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  51.85 
 
 
338 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  50.92 
 
 
328 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  52.57 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  49.45 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  48.53 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  52.67 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  52.94 
 
 
273 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  48.7 
 
 
292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  53.14 
 
 
273 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  52.57 
 
 
273 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  48.52 
 
 
272 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  48.53 
 
 
324 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  48.53 
 
 
324 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 
286 aa  279  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  47.79 
 
 
273 aa  279  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
281 aa  277  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  48.53 
 
 
271 aa  276  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  49.24 
 
 
278 aa  275  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  47.79 
 
 
324 aa  275  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  47.74 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  49.43 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  48.16 
 
 
273 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  50.93 
 
 
276 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  47.83 
 
 
276 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  48.18 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  46.89 
 
 
275 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  50 
 
 
326 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  50 
 
 
326 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  47.08 
 
 
274 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  48.86 
 
 
278 aa  266  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  48.29 
 
 
279 aa  266  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  47.46 
 
 
276 aa  265  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  48.34 
 
 
276 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  49.26 
 
 
326 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  47.27 
 
 
276 aa  265  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  48.9 
 
 
274 aa  264  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  47.83 
 
 
277 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  51.33 
 
 
278 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  49.43 
 
 
278 aa  262  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  49.43 
 
 
278 aa  262  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  49.43 
 
 
278 aa  262  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  49.43 
 
 
278 aa  262  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  45.79 
 
 
274 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  45.79 
 
 
274 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  49.81 
 
 
278 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 
276 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  45.79 
 
 
274 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  54.04 
 
 
235 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  48.51 
 
 
278 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  46.01 
 
 
276 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>