More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5253 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  100 
 
 		 272 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  99.26 
 
 		 272 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  95.59 
 
 		 272 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  85.66 
 
 		 272 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  80.07 
 
 		 272 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  80.37 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  74.91 
 
 		 272 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  72.43 
 
 		 273 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  61.76 
 
 		 273 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  61.76 
 
 		 273 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  61.76 
 
 		 273 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  59.19 
 
 		 334 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  57.72 
 
 		 273 aa  335  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  61.03 
 
 		 273 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  60.66 
 
 		 273 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  56.99 
 
 		 290 aa  329  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  56.62 
 
 		 273 aa  328  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  56.25 
 
 		 273 aa  328  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  57.2 
 
 		 273 aa  327  9e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  56.83 
 
 		 273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  55.84 
 
 		 274 aa  324  7e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  56.41 
 
 		 273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  54.58 
 
 		 274 aa  318  9e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  56.25 
 
 		 273 aa  316  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  56.2 
 
 		 274 aa  315  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  53.85 
 
 		 280 aa  315  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  55.64 
 
 		 276 aa  315  7e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  56.25 
 
 		 273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  54.89 
 
 		 330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  54.58 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  54.24 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  53.31 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  53.31 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  53.31 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  53.68 
 
 		 273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  53.68 
 
 		 273 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  52.75 
 
 		 273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  54.61 
 
 		 322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  53.11 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  55.64 
 
 		 317 aa  305  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  52.57 
 
 		 273 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  52.42 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  56.41 
 
 		 277 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  53.68 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  53.31 
 
 		 273 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  52.96 
 
 		 340 aa  298  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  52.01 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  52.42 
 
 		 324 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  51.84 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  54.78 
 
 		 273 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  54.78 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  54.98 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  52.77 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  51.46 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  51.1 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 		 273 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  52.57 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  50.37 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  52.94 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  52.94 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  52.83 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  52.57 
 
 		 326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  50.36 
 
 		 275 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  48.16 
 
 		 273 aa  281  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  48.15 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  49.82 
 
 		 272 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  50.56 
 
 		 276 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  49.44 
 
 		 297 aa  275  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  49.26 
 
 		 276 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  47.43 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  47.62 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  47.62 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  48.55 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  48 
 
 		 275 aa  271  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  47.79 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  51.84 
 
 		 274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  49.24 
 
 		 279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  48.9 
 
 		 343 aa  268  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  48.86 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  47.99 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  49.43 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  49.09 
 
 		 276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  48.72 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  49.09 
 
 		 276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  48.73 
 
 		 276 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  48.36 
 
 		 276 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  50.74 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  46.35 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  48.28 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  47.27 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  48.09 
 
 		 279 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2506  alpha/beta hydrolase fold protein  47.29 
 
 		 278 aa  261  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal  0.76574 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  48.36 
 
 		 277 aa  261  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  46.91 
 
 		 276 aa  261  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  56.41 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  46.52 
 
 		 274 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  48 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  46.55 
 
 		 276 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  46.15 
 
 		 274 aa  259  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>