More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0086 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  96.42 
 
 		 279 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  63.44 
 
 		 290 aa  392  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  62.18 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  57.19 
 
 		 286 aa  357  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  55.43 
 
 		 277 aa  325  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  54.91 
 
 		 277 aa  318  7e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  53.79 
 
 		 277 aa  311  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  53.07 
 
 		 277 aa  301  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  51.99 
 
 		 294 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2691  alpha/beta hydrolase fold protein  54.18 
 
 		 276 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  51.44 
 
 		 278 aa  288  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3228  alpha/beta hydrolase fold protein  52.52 
 
 		 278 aa  288  6e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  53.38 
 
 		 278 aa  288  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  53.38 
 
 		 278 aa  288  9e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  50.18 
 
 		 280 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  51.8 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  52.67 
 
 		 278 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  52.67 
 
 		 278 aa  285  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  52.67 
 
 		 278 aa  285  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  52.67 
 
 		 278 aa  285  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  52.31 
 
 		 278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  50.76 
 
 		 272 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  48.25 
 
 		 297 aa  268  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  48.29 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34740  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  50 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  48.66 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  48.09 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  48.09 
 
 		 272 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  46.95 
 
 		 275 aa  261  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  48.85 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  48.29 
 
 		 273 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  49.28 
 
 		 278 aa  258  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  44.77 
 
 		 276 aa  258  9e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  46.56 
 
 		 273 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  48.87 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  46.95 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  48.88 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  44.4 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  46.93 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  45.32 
 
 		 273 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 		 269 aa  244  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  45.08 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  48.3 
 
 		 273 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  43.07 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  47.55 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  47.55 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  47.23 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  46.07 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  45.15 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  47.01 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  44.27 
 
 		 274 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  43.73 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  43.35 
 
 		 334 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  41.83 
 
 		 330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  42.24 
 
 		 273 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  43.77 
 
 		 273 aa  222  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  43.51 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  42.34 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  46.27 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 		 273 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  44.06 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  43.98 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  46.72 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4189  chloride peroxidase  50.71 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  41.06 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  43.35 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  41.83 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  41.52 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  41.44 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  41.16 
 
 		 273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  39.35 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  40.14 
 
 		 275 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  41.83 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.29 
 
 		 273 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  39.93 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  39.93 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  41.13 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  40.84 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  39.71 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  41.67 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  40.44 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 		 274 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  41.44 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  39.69 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  38.63 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 		 272 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 338 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>