More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3084 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  98.68 
 
 		 273 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  70.82 
 
 		 273 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  60.35 
 
 		 272 aa  285  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  57.52 
 
 		 297 aa  281  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  57.51 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  51.29 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  56.39 
 
 		 273 aa  269  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  56.14 
 
 		 273 aa  268  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 		 273 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 		 273 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  57.08 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  55.95 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  56.41 
 
 		 272 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  56.41 
 
 		 272 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  54.04 
 
 		 272 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  56.22 
 
 		 272 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  54.63 
 
 		 273 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  54.19 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  53.85 
 
 		 272 aa  244  9e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  46.7 
 
 		 297 aa  241  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  50.43 
 
 		 278 aa  236  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  49.78 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  50.44 
 
 		 317 aa  230  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  49.79 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  49.78 
 
 		 278 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  49.78 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  50.22 
 
 		 290 aa  228  8e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  49.34 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  49.34 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  49.34 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  49.34 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  50.44 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  49.34 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  48.23 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  46.38 
 
 		 273 aa  222  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  46.72 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  47.6 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  46.81 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  46.28 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  46.72 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  45.99 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  45.37 
 
 		 276 aa  215  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 		 274 aa  215  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  48.71 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  47.37 
 
 		 277 aa  210  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  48.03 
 
 		 278 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  45.58 
 
 		 273 aa  209  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  44.54 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.3 
 
 		 273 aa  208  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  47.79 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  44.3 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  44.74 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  43.67 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  43.36 
 
 		 280 aa  203  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  44.74 
 
 		 338 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  44.25 
 
 		 340 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 		 273 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  45.53 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  43.17 
 
 		 330 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  43.11 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  45.06 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  42.67 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  43.42 
 
 		 277 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  43.42 
 
 		 277 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  43.42 
 
 		 277 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  46.49 
 
 		 286 aa  197  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  46.93 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  38.33 
 
 		 276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  42.48 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  42.29 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  41.05 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  45.22 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  42.98 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  42.98 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  41.92 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  44.3 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 276 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  45.85 
 
 		 294 aa  190  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  42.67 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  44.05 
 
 		 277 aa  189  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 273 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  39.21 
 
 		 324 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  45.18 
 
 		 278 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  42.54 
 
 		 277 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  46.52 
 
 		 281 aa  185  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  43.42 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  41.23 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  40.79 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4084  chloride peroxidase  40.44 
 
 		 234 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  42.54 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  44.1 
 
 		 273 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0477  twin-arginine translocation pathway signal  44.49 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  39.65 
 
 		 324 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  40.97 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>