More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34740 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_34740  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
280 aa  570  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0253397  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  77.7 
 
 
280 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  71.94 
 
 
275 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  69.64 
 
 
277 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  69.29 
 
 
277 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  67.14 
 
 
277 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  63.57 
 
 
294 aa  359  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3228  alpha/beta hydrolase fold protein  66.9 
 
 
278 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  54.32 
 
 
277 aa  309  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  50.69 
 
 
286 aa  298  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  51.8 
 
 
279 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4189  chloride peroxidase  65.26 
 
 
257 aa  285  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2691  alpha/beta hydrolase fold protein  52.88 
 
 
276 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78539  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  49.82 
 
 
281 aa  276  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  49.29 
 
 
290 aa  275  5e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  46.98 
 
 
281 aa  259  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  47.17 
 
 
273 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  45.04 
 
 
278 aa  239  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  46.43 
 
 
278 aa  235  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  42.18 
 
 
276 aa  233  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  46.15 
 
 
297 aa  231  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  46.13 
 
 
272 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  45.13 
 
 
272 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  46.07 
 
 
278 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  45.36 
 
 
278 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  45.36 
 
 
278 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  45.36 
 
 
278 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  45.36 
 
 
278 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  45.71 
 
 
278 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  45.11 
 
 
272 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  44.13 
 
 
278 aa  224  9e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  44.65 
 
 
273 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  45.32 
 
 
272 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  43.54 
 
 
272 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  44.81 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  43.45 
 
 
272 aa  214  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  41.7 
 
 
278 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
334 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  43.98 
 
 
273 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  44.15 
 
 
273 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  44.15 
 
 
273 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  41.49 
 
 
281 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  41.51 
 
 
273 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  38.01 
 
 
297 aa  205  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  41.13 
 
 
273 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  42.7 
 
 
273 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  43.77 
 
 
273 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  42.7 
 
 
273 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  39.15 
 
 
292 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  42.64 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  42.38 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  42.49 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  42.22 
 
 
278 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 
290 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  42.75 
 
 
277 aa  191  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 
274 aa  191  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  40.66 
 
 
286 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  39.41 
 
 
338 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
276 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  39.55 
 
 
275 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 
340 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  38.11 
 
 
273 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 
274 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  38.35 
 
 
273 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.69 
 
 
281 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  37.97 
 
 
273 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  38.11 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  37.36 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  38.26 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  43.91 
 
 
235 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  39.85 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.49 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 
328 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 
274 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 
273 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  38.11 
 
 
273 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
324 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  39.64 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
274 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
275 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
324 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
330 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 
273 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  38.81 
 
 
278 aa  175  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  38.11 
 
 
273 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  37.09 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  39.33 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 
322 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  36.47 
 
 
274 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>