More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3969 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 276 aa  568  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  79.04 
 
 		 328 aa  457  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2506  alpha/beta hydrolase fold protein  77.09 
 
 		 278 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal  0.76574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2211  alpha/beta hydrolase fold  76.36 
 
 		 278 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  73.12 
 
 		 338 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  74.82 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  74.28 
 
 		 276 aa  434  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  73.99 
 
 		 276 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  75.74 
 
 		 274 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  72.04 
 
 		 280 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  70.11 
 
 		 274 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  73.45 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  72.46 
 
 		 278 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1660  alpha/beta hydrolase fold  72.36 
 
 		 278 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6475  alpha/beta hydrolase fold  74.91 
 
 		 278 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  70.97 
 
 		 280 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6920  Alpha/beta hydrolase  72.26 
 
 		 278 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  67.51 
 
 		 343 aa  414  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3920  alpha/beta hydrolase fold protein  72 
 
 		 278 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  71.85 
 
 		 274 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5723  alpha/beta hydrolase fold  74.18 
 
 		 278 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  71.85 
 
 		 274 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  71.01 
 
 		 278 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  69.57 
 
 		 342 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  70.11 
 
 		 272 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  70.74 
 
 		 274 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  70.22 
 
 		 276 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  70.65 
 
 		 278 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  70.65 
 
 		 278 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3628  alpha/beta hydrolase fold  72.36 
 
 		 278 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  70.59 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  68.89 
 
 		 274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  69.93 
 
 		 278 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3910  alpha/beta hydrolase fold  72.73 
 
 		 278 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0228163  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  69.93 
 
 		 278 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  69.93 
 
 		 278 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  67.52 
 
 		 276 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  67.52 
 
 		 276 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  67.4 
 
 		 276 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  67.52 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  67.4 
 
 		 276 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5597  non-heme haloperoxidase  68.27 
 
 		 274 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  66.06 
 
 		 276 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  66.42 
 
 		 276 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  67.4 
 
 		 274 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  66.06 
 
 		 276 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  66.06 
 
 		 276 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  65.33 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  65.19 
 
 		 274 aa  391  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  67.03 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  65.56 
 
 		 274 aa  387  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  65.44 
 
 		 273 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  63.97 
 
 		 330 aa  384  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  65.44 
 
 		 276 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  66.3 
 
 		 280 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  65.19 
 
 		 273 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  65.57 
 
 		 277 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0455  alpha/beta hydrolase fold  67.64 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  61.85 
 
 		 273 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  63.7 
 
 		 274 aa  368  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  62.96 
 
 		 273 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  62.36 
 
 		 273 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  64.31 
 
 		 273 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  61.48 
 
 		 271 aa  359  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  61.76 
 
 		 273 aa  359  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  63.2 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  60.29 
 
 		 273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  59.93 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  60.29 
 
 		 324 aa  351  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  62.13 
 
 		 277 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  62.13 
 
 		 277 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  62.13 
 
 		 277 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  61.11 
 
 		 273 aa  350  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  59.63 
 
 		 273 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  62.04 
 
 		 326 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  62.04 
 
 		 326 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  59.93 
 
 		 274 aa  345  4e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  58.33 
 
 		 317 aa  344  7e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  61.31 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  62.45 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  62.22 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  60.74 
 
 		 274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  62.22 
 
 		 273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  59.26 
 
 		 290 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  61.48 
 
 		 273 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  59.85 
 
 		 322 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  58.3 
 
 		 274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  59.19 
 
 		 273 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 		 273 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  59.63 
 
 		 273 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  58.3 
 
 		 273 aa  330  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  55.11 
 
 		 324 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  57.99 
 
 		 274 aa  328  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  57.66 
 
 		 322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  55.72 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  54.51 
 
 		 338 aa  325  6e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  56.88 
 
 		 334 aa  325  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  54.35 
 
 		 340 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  56.46 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  54.81 
 
 		 276 aa  311  5.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>