More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2449 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  52.04 
 
 		 270 aa  261  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  50.57 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  53.21 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  48.45 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  48.45 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  48.45 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  50.39 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  47.67 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  47.33 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 270 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.68 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.65 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.75 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  29.13 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.25 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 305 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  31.75 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  29.37 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  29.66 
 
 		 268 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3228  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  31.1 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.97 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.7 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  27.51 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.62 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.05 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  42.72 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  24.89 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.64 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>