More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1222 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  37.92 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  34.14 
 
 
283 aa  161  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
265 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
266 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
266 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 
266 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
264 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
263 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  27.06 
 
 
264 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
280 aa  125  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.64 
 
 
248 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 
265 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  23.92 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.34 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  23.53 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
263 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
263 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  23.14 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
237 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
273 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 
262 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
255 aa  106  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
273 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
239 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
277 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
279 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.34 
 
 
289 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
270 aa  99  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  24.12 
 
 
265 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  25.21 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.24 
 
 
425 aa  95.9  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
277 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
245 aa  95.5  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  25.59 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
284 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  24.17 
 
 
392 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.69 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.2 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
286 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
297 aa  92.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 
235 aa  92.4  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.76 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  25.39 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  22.71 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  24.52 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.31 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.05 
 
 
259 aa  89.4  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  25.51 
 
 
267 aa  89  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
264 aa  89  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  23.73 
 
 
380 aa  88.6  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  25.19 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  24.8 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  24.22 
 
 
263 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 
267 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
387 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  25.44 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  23.81 
 
 
386 aa  85.5  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  24.31 
 
 
282 aa  85.1  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  24.67 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  23.9 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  28.37 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  28.57 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  25.61 
 
 
387 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  24.46 
 
 
393 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>