More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5939 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
275 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  89.93 
 
 
269 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  71.91 
 
 
268 aa  407  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  60.3 
 
 
267 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  58.94 
 
 
263 aa  331  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  58.24 
 
 
263 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  55.09 
 
 
264 aa  315  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  47.06 
 
 
263 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  47.66 
 
 
262 aa  229  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  45.59 
 
 
266 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  44.27 
 
 
262 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  43.41 
 
 
268 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  42.02 
 
 
386 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1118  3-oxoadipate enol-lactonase  44.91 
 
 
266 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  38.52 
 
 
264 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  40.54 
 
 
262 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  40.54 
 
 
262 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  40.54 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  41.67 
 
 
392 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
263 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 
279 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  39 
 
 
263 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  40.98 
 
 
261 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  38.33 
 
 
260 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  39.15 
 
 
263 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  36.55 
 
 
373 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  38.13 
 
 
259 aa  168  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  34.98 
 
 
282 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  35.91 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  38.37 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  35.91 
 
 
261 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  38.76 
 
 
263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  37.65 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 
261 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  38.37 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  37.7 
 
 
396 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  37.31 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  34.65 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  37.25 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  37.25 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  37.6 
 
 
263 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  36.74 
 
 
263 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  38.37 
 
 
262 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  38.37 
 
 
360 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  35.91 
 
 
261 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  36.68 
 
 
261 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  36.68 
 
 
261 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  36.68 
 
 
261 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  36.72 
 
 
270 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 
261 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.29 
 
 
261 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 
261 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 
261 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 
261 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 
261 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  37.4 
 
 
263 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  35.52 
 
 
263 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  35.74 
 
 
255 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
279 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  34.5 
 
 
260 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  34.5 
 
 
260 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 
261 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  40.47 
 
 
393 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  34.75 
 
 
263 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  35.16 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  35.16 
 
 
270 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  37.2 
 
 
256 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  35.86 
 
 
269 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
262 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 
261 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 
262 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  36.64 
 
 
262 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  36.11 
 
 
258 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  36.13 
 
 
263 aa  148  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  39.92 
 
 
393 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  37.55 
 
 
390 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.42 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  34.16 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  35.77 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.56 
 
 
425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  37.05 
 
 
377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  33.72 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 
258 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  33.99 
 
 
251 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  35.02 
 
 
260 aa  143  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  34.03 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  34.6 
 
 
271 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  34.57 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  33.07 
 
 
389 aa  138  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 
282 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  34.82 
 
 
265 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
254 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 
256 aa  131  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  32.1 
 
 
396 aa  131  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  35.77 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  35.55 
 
 
393 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>