More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6107 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 231 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  50.41 
 
 		 248 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  44.86 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  49.16 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  47.97 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  38.84 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  44.58 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  44.07 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  38.37 
 
 		 265 aa  128  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  43.67 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  39.51 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  40.97 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  40.76 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  41.42 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  42.45 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  34.18 
 
 		 264 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  36.44 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  40.08 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 		 264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.73 
 
 		 277 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  35.47 
 
 		 259 aa  98.6  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 263 aa  98.2  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 264 aa  97.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  33.76 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 		 279 aa  89.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  37.66 
 
 		 237 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  38.86 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 		 245 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  33.76 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  31.09 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  34.15 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  35.53 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  28.09 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  31.86 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  37.43 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.63 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  26.1 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  27.64 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  29.39 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  29.39 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  29.39 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.31 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  25.99 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 275 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.42 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  30.38 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  26.15 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.15 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  33.05 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  31.67 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.02 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  27.02 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  33.68 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  28.46 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.15 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  35.44 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 259 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>