More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1738 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 241 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  56.42 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  46.93 
 
 		 235 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  43.16 
 
 		 239 aa  138  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  37.61 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  37.44 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  42.36 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  40.89 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  37.61 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  38.2 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  37.17 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  42 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  34.36 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  27.59 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  31.8 
 
 		 267 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  31.91 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.41 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.92 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  30.04 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  31.03 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  31.15 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.76 
 
 		 266 aa  72  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  28.19 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.79 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  28.93 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  28.93 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  28.93 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  33.02 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.32 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.11 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.53 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.74 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  35.75 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  33.52 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2368  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  33.52 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  31.12 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.21 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  27.69 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  27.49 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.49 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.51 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.29 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.51 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  22.76 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  21.34 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  26.51 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.82 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  31.25 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  21.34 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  26.59 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 369 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 369 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>