More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3423 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  100 
 
 		 238 aa  483  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  99.58 
 
 		 251 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  99.58 
 
 		 251 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  74.24 
 
 		 229 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  54.02 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  31.6 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  30.09 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  30.57 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  31.17 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  31.5 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  28.7 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  26.15 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  26.55 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3138  hypothetical protein  29.41 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.766563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  30.91 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  28.8 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.73 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  29.28 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  27.81 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.12 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  26.81 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  52.17 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3646  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  23.59 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  21.33 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.41 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  34.44 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  34.07 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  25.14 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  25.44 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.96 
 
 		 330 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  43.86 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.28 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  43.86 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.22 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.51 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  26.25 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  43.86 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>