More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1118 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
275 aa  567  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  89.82 
 
 
275 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  88.73 
 
 
275 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
258 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  28.63 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
264 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 
268 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
265 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
264 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
263 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
252 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  30.37 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
284 aa  99.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
265 aa  99  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.85 
 
 
263 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  28.15 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  29.56 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  29.34 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
502 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  28.06 
 
 
267 aa  92  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
273 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  26.39 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
302 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.89 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  27.27 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.14 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
275 aa  89  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
260 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
270 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  27.14 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  27.14 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  28.41 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  25.78 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
295 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
270 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
278 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 
296 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  27.14 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.85 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  27.14 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  29.43 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  28.3 
 
 
262 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
279 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.39 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  25.87 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.85 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.19 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  27.41 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  26.79 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.17 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.95 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.82 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.99 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.41 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.77 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.77 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.17 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 
292 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
291 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>