More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1703 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
502 aa  1031    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  46.15 
 
 
291 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  42.75 
 
 
270 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2726  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 
226 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62021  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2982  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 
226 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0509  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
275 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0214  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 
220 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3493  hypothetical protein  36.02 
 
 
212 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
275 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 
283 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2917  hypothetical protein  33.94 
 
 
225 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4031  hypothetical protein  32.7 
 
 
211 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0211  hypothetical protein  32.7 
 
 
211 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  31.5 
 
 
258 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  29.62 
 
 
275 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
252 aa  103  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
260 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  29.62 
 
 
275 aa  100  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
258 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
273 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
265 aa  96.3  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
275 aa  92.4  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3889  hypothetical protein  29.58 
 
 
206 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3808  hypothetical protein  30.16 
 
 
206 aa  87.8  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 
286 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 
271 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 
269 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
270 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.57 
 
 
270 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0186  hypothetical protein  26.5 
 
 
231 aa  77  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
280 aa  77  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.36 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 
265 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  25.78 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.56 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  26.46 
 
 
269 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
277 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.35 
 
 
282 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.87 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
278 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  26.54 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.97 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.87 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.86 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
277 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.7 
 
 
286 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  35.81 
 
 
272 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  27.07 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.51 
 
 
270 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  27.07 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  25.5 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  27.07 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0034  hypothetical protein  26.79 
 
 
231 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  25.7 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
284 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 
266 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
267 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  24.2 
 
 
333 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  26.6 
 
 
282 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  23.75 
 
 
263 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
266 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 
279 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
263 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 
283 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
296 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.35 
 
 
270 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
257 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
282 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
262 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
270 aa  63.9  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2775  alpha/beta hydrolase fold protein  22.99 
 
 
621 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.35 
 
 
270 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
259 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.34 
 
 
261 aa  63.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  23.62 
 
 
279 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.07 
 
 
400 aa  63.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  20.46 
 
 
264 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  28.35 
 
 
272 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  23.57 
 
 
282 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  25.71 
 
 
260 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>