More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4494 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 		 270 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  53.33 
 
 		 291 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 		 502 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  34.08 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0509  alpha/beta hydrolase fold  38.01 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  29.28 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  29.62 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  31.37 
 
 		 258 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.96 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  26.52 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.06 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.61 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  35.42 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.28 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0037  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27.51 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.29 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  39.13 
 
 		 380 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.74 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  21.83 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  26.54 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  28.46 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  27.86 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.39 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.93 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.34 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  33.03 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  27.72 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  28.35 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  23.68 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>