More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4089 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  100 
 
 		 262 aa  544  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  74.81 
 
 		 267 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  66.79 
 
 		 270 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  67.94 
 
 		 270 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  67.56 
 
 		 270 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  66.03 
 
 		 270 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  67.05 
 
 		 265 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  59.77 
 
 		 275 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  58.62 
 
 		 275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  34.36 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  34.63 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.8 
 
 		 425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.38 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 282 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  31.58 
 
 		 282 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 425 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.59 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  31.82 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  31.73 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  30.27 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.6 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  29.8 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.73 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 		 277 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  29.58 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  31.7 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.14 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  31.32 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  29.06 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.92 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  30.6 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.92 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  29.28 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30.23 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  29.06 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  29.28 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  25.56 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  30.42 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  29.5 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>