More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1492 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  98.97 
 
 
291 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  90.72 
 
 
291 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  89.69 
 
 
291 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  74.48 
 
 
287 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  47.48 
 
 
278 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  39.78 
 
 
304 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  39.78 
 
 
304 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  39.78 
 
 
304 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 
291 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 
290 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
290 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  39.44 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  42.41 
 
 
290 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  38.87 
 
 
295 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
292 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 
294 aa  178  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  38.77 
 
 
294 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 
298 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 
290 aa  175  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
287 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
291 aa  175  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
297 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  35.62 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  39.16 
 
 
292 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  42.18 
 
 
289 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  38.81 
 
 
297 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  39.93 
 
 
292 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  38.3 
 
 
293 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 
291 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
283 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  42.7 
 
 
292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 
292 aa  165  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
288 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 
300 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 
312 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  37.32 
 
 
316 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
287 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 
262 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  37.32 
 
 
297 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  37.32 
 
 
297 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 
284 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  37.96 
 
 
320 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  39.65 
 
 
294 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
298 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 
299 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  36.61 
 
 
295 aa  159  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
286 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 
304 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  36.97 
 
 
316 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 
289 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 
289 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  37.23 
 
 
323 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
282 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
290 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 
309 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
335 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  34.95 
 
 
294 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 
296 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  39.48 
 
 
298 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 
321 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
291 aa  152  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  36.2 
 
 
324 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 
305 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
296 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
299 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
288 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 
303 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  37.26 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  37.26 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
306 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
306 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  35.09 
 
 
312 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  34.72 
 
 
335 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 
309 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
298 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  35.36 
 
 
294 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  36.9 
 
 
297 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  36.4 
 
 
301 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
300 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 
301 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  35.47 
 
 
308 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  36.5 
 
 
298 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
292 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 
317 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>