More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3643 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
284 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 
283 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 
268 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  33.81 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  29.59 
 
 
275 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 
258 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  31.92 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
275 aa  99.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  29.59 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.36 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
226 aa  92.4  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  31.37 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
425 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.74 
 
 
263 aa  86.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
302 aa  85.9  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
265 aa  85.9  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
502 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  29.04 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  32.18 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  28.96 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  27.74 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.29 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
273 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  32 
 
 
261 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
261 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.17 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.43 
 
 
397 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  24.71 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  28.85 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  25.21 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  29.61 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  29.23 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.17 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  28.46 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.6 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.64 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  29.32 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.83 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.36 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.47 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.24 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  27.86 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
387 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  30.18 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>