More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3588 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
282 aa  558  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  53.52 
 
 
283 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  46.13 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  32.84 
 
 
275 aa  145  9e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
275 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  31.11 
 
 
275 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
502 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
252 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 
269 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 
284 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
260 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  33.57 
 
 
291 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
268 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
258 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  34.18 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.48 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.48 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  31.01 
 
 
270 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.48 
 
 
256 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  30.26 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  27.49 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  32.73 
 
 
265 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.99 
 
 
271 aa  92.4  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  31.29 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
271 aa  89  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  28.03 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  28.09 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.84 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.77 
 
 
392 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4392  putative dioxygenase  39.29 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.53 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0509  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.22 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.59 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.03 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.16 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.78 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.57 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.67 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  28.72 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.9 
 
 
397 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  40.34 
 
 
256 aa  79  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
276 aa  79  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.26 
 
 
282 aa  79  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  27.15 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.53 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  28.32 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.66 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  30.69 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  28.33 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  33.69 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.76 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  41.07 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.31 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.27 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
304 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  30.8 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  34.82 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.1 
 
 
263 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  29.09 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>