More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1429 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
267 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  74.81 
 
 
262 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  72.9 
 
 
270 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  72.52 
 
 
270 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  71.76 
 
 
270 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  71.37 
 
 
270 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  69.08 
 
 
265 aa  387  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  62.64 
 
 
275 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  62.26 
 
 
275 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  34.3 
 
 
268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
273 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.78 
 
 
425 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 
282 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  31.8 
 
 
263 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 
261 aa  122  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
279 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 
277 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  31.76 
 
 
260 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
279 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  27.8 
 
 
282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.94 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  32.44 
 
 
277 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
286 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.28 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
277 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 
271 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.46 
 
 
267 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
254 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
277 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.59 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
425 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
260 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.03 
 
 
282 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  33.21 
 
 
263 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
259 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 
268 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  30.31 
 
 
265 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
284 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.54 
 
 
261 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
263 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
350 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
260 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
284 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
282 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
308 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
280 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
257 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  27.27 
 
 
263 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
291 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
263 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
297 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.88 
 
 
266 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  27 
 
 
260 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  30.27 
 
 
262 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
256 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  31.54 
 
 
273 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  27.99 
 
 
279 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  28.47 
 
 
287 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  26.42 
 
 
261 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.42 
 
 
261 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
291 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
296 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
271 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
278 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 
262 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
275 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
283 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
271 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  26.42 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  27.08 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  27.08 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  27.08 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
294 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.64 
 
 
286 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
262 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
287 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  26.42 
 
 
261 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.18 
 
 
256 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
278 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  27.11 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
270 aa  99  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  25.28 
 
 
261 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
253 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  25.28 
 
 
261 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>