More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1645 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  61.45 
 
 		 276 aa  348  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  61.45 
 
 		 276 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  61.45 
 
 		 276 aa  346  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  62.04 
 
 		 277 aa  345  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  60.66 
 
 		 276 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  60.14 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  55.96 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  59.78 
 
 		 276 aa  331  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  59.78 
 
 		 280 aa  331  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  59.42 
 
 		 276 aa  328  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  55.64 
 
 		 284 aa  315  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  52.73 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  54.51 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  51.29 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  53.76 
 
 		 275 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  51.56 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  45.69 
 
 		 270 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  46.3 
 
 		 271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  45.8 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  45.76 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  46.21 
 
 		 274 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  44.57 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.11 
 
 		 372 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  44.11 
 
 		 328 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.4 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.75 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  44.75 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.11 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  43.17 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  45.86 
 
 		 274 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 282 aa  205  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  43.51 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  28.37 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.77 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.38 
 
 		 292 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  29.48 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  30.04 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 264 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.51 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.28 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  28.41 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.3 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.16 
 
 		 392 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.85 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  28.11 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.08 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.12 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  28.91 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  28.91 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.91 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  28.91 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  27.44 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.35 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.91 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  27.42 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  27.42 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.98 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  25.94 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.53 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.7 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>