More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5984 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
300 aa  614  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  67.94 
 
 
263 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
273 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
276 aa  135  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
263 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.7 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
270 aa  125  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
270 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  34.47 
 
 
266 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 
271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
266 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  28.41 
 
 
283 aa  116  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
265 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  33.83 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.36 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
270 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  32.54 
 
 
256 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.86 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
280 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
266 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  33.87 
 
 
256 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  33.87 
 
 
256 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  33.87 
 
 
256 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  32.72 
 
 
272 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 
261 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
271 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 
284 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
272 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 
284 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  29.5 
 
 
263 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 
273 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  32.71 
 
 
270 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
263 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  35.51 
 
 
284 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  30.51 
 
 
264 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  30.71 
 
 
258 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.12 
 
 
274 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  31.73 
 
 
256 aa  99.4  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
392 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
268 aa  99.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  33.09 
 
 
265 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2775  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 
621 aa  99  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  32.7 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.47 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
226 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.63 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.4 
 
 
248 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  30.22 
 
 
261 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  28.1 
 
 
259 aa  95.9  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  28.42 
 
 
263 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
277 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  31.37 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16740  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.25 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.554101  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  28.21 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 
263 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.86 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 
259 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  28.31 
 
 
264 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
267 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  29.64 
 
 
287 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.77 
 
 
328 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 
268 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.14 
 
 
261 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.22 
 
 
425 aa  93.2  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  28.79 
 
 
264 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  31.99 
 
 
261 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.46 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 
270 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  30.68 
 
 
269 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 
250 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  28.27 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.4 
 
 
372 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  29.52 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.93 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
266 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  28.94 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>