More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2125 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  75.72 
 
 		 277 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  78.1 
 
 		 276 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  77.74 
 
 		 276 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  77.37 
 
 		 276 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  74.18 
 
 		 276 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  77.37 
 
 		 276 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  73.09 
 
 		 276 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  73.45 
 
 		 276 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  62.82 
 
 		 278 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  63.5 
 
 		 276 aa  371  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  60.95 
 
 		 277 aa  358  7e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  64.29 
 
 		 284 aa  349  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  59.78 
 
 		 275 aa  331  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  57.95 
 
 		 271 aa  324  9e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  55.64 
 
 		 275 aa  323  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  55.73 
 
 		 270 aa  306  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  41.85 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  49.42 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  49.42 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  48.65 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  47.71 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  45.69 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  48.26 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.57 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  44.57 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  44.57 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.57 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.57 
 
 		 372 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  47.71 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.49 
 
 		 274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  43.12 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  44.4 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  45.15 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.77 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.86 
 
 		 283 aa  95.9  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.82 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.61 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.19 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.25 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.67 
 
 		 292 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.89 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.92 
 
 		 425 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  29.25 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.29 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  25.3 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  25.3 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.85 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 		 256 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 277 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  26.05 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  29.26 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  26.17 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  26.57 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.97 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  24.8 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>