More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1295 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 
265 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  69.08 
 
 
267 aa  387  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  67.05 
 
 
262 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  63.02 
 
 
270 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  61.51 
 
 
270 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  62.26 
 
 
270 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  61.51 
 
 
270 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  64.5 
 
 
275 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  63.74 
 
 
275 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
273 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
273 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
271 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.13 
 
 
282 aa  128  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  29.28 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  36.61 
 
 
263 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 
265 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  32.83 
 
 
259 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 
425 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  32.45 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  30.94 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  32.08 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  32.45 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.32 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  32.45 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.52 
 
 
279 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.32 
 
 
261 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
278 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 
277 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  31.32 
 
 
261 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.42 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  30.42 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.56 
 
 
425 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  33.58 
 
 
282 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
271 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
276 aa  115  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.88 
 
 
263 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  33.95 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  31.41 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  28.46 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  32.51 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  34.11 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  30.27 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  32.21 
 
 
266 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
267 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
271 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
280 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 
277 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
275 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
269 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.41 
 
 
263 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  29.28 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.25 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.25 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.66 
 
 
260 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.83 
 
 
396 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  31.54 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  31.78 
 
 
262 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 
271 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
272 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.42 
 
 
265 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>