More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0321 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 264 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  93.92 
 
 		 265 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  61.39 
 
 		 266 aa  322  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  54.44 
 
 		 266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  53.64 
 
 		 266 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  55.08 
 
 		 280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  39.31 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  34.75 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  37.64 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  39.92 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  38.31 
 
 		 265 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  33.74 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 265 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.7 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  32.44 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  34.98 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  34.11 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.19 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  33.85 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.18 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  30.26 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  32.95 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 273 aa  122  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 279 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  31.69 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 292 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 279 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  32.96 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  28.89 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.2 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  32.92 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.93 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.93 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.93 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 		 279 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  29.28 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  30.36 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  31.13 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  29.26 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 276 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.15 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  32.71 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.55 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  32.3 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  29.18 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 425 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>