More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2473 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 277 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  84 
 
 		 276 aa  480  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  83.64 
 
 		 276 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  82.18 
 
 		 276 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  75.72 
 
 		 280 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  75.18 
 
 		 276 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  75.18 
 
 		 276 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  74.82 
 
 		 276 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  74.09 
 
 		 276 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  62.41 
 
 		 278 aa  377  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  61.68 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  59.85 
 
 		 277 aa  361  8e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  61.99 
 
 		 284 aa  353  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  62.04 
 
 		 275 aa  345  7e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  59.7 
 
 		 271 aa  340  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  58.18 
 
 		 275 aa  337  9e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  56.82 
 
 		 270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  50.38 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  50.38 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  51.72 
 
 		 274 aa  244  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 		 274 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  48.31 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  47.92 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  46.42 
 
 		 270 aa  228  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  45.39 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.94 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  44.61 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.61 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  44.61 
 
 		 328 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.61 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.61 
 
 		 328 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  41.85 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  44.12 
 
 		 238 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  29.35 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.59 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  29.34 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.59 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  26.12 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  26.52 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.91 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.31 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.98 
 
 		 283 aa  86.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.15 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  26.84 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.05 
 
 		 248 aa  85.5  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.71 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  25.61 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  25.4 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  25.61 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.15 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.42 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.42 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  25.88 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  25.09 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>