More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1989 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
284 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  64.58 
 
 
276 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  64.94 
 
 
276 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  64.23 
 
 
276 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  61.54 
 
 
278 aa  362  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  64.44 
 
 
276 aa  362  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  60.58 
 
 
276 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  63.5 
 
 
276 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  63.5 
 
 
276 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  62.77 
 
 
276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  61.99 
 
 
277 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  64.29 
 
 
280 aa  349  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  55.84 
 
 
277 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  57.25 
 
 
275 aa  318  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  58.11 
 
 
271 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  55.64 
 
 
275 aa  315  8e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  54.17 
 
 
270 aa  295  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  40.3 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  45.21 
 
 
274 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 
274 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  44.23 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 
274 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 
274 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  40.82 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  40.82 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  40.82 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  40.82 
 
 
328 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  40.82 
 
 
372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  41.35 
 
 
274 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 
274 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  41.64 
 
 
271 aa  205  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 
270 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
285 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  42.61 
 
 
238 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 
270 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  39.15 
 
 
267 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
273 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
265 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
265 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
276 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
264 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
264 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.35 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.23 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.12 
 
 
292 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.85 
 
 
277 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.14 
 
 
259 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
273 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
261 aa  92  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.35 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.45 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
265 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
261 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.85 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.19 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  27.44 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
333 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 
261 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.27 
 
 
261 aa  85.5  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  24.6 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.72 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.71 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.8 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  26.1 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
283 aa  82  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  29.26 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  23.41 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  24.23 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  29.26 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>