More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2174 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
261 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 
261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  51.35 
 
 
263 aa  265  8e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  49.61 
 
 
264 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  48.22 
 
 
262 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  44.79 
 
 
263 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  45.53 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
263 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
263 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  37.6 
 
 
265 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  31.78 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  30.83 
 
 
277 aa  145  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.81 
 
 
263 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  33.75 
 
 
264 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
264 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 
263 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.19 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
264 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  36.25 
 
 
263 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
255 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 
264 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
266 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 
263 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
235 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
276 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
254 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.6 
 
 
271 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  30.04 
 
 
275 aa  99  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.17 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.92 
 
 
289 aa  96.3  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.98 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
280 aa  92.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.74 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  29.59 
 
 
233 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
231 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
279 aa  89  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
274 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
276 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
276 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
274 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
233 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
276 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
274 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
276 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
276 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  27.89 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.89 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  27.89 
 
 
328 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.89 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.89 
 
 
328 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  26.72 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  30.64 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  26.83 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  30.11 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  27.49 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.89 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  24.15 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
273 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  27.08 
 
 
265 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  26.47 
 
 
237 aa  79  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  24.21 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  24.3 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  25.69 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  25.69 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  23.37 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  23.81 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  26.8 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.36 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>