More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0050 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  65.93 
 
 
271 aa  378  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  66.67 
 
 
275 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  53.76 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  59.09 
 
 
276 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  57.2 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  57.58 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  56.39 
 
 
276 aa  318  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  57.95 
 
 
276 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  58.71 
 
 
276 aa  317  9e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  58.33 
 
 
276 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  56.6 
 
 
278 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  56.82 
 
 
276 aa  315  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  56.82 
 
 
277 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  55.73 
 
 
280 aa  306  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  54.17 
 
 
284 aa  295  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  51.56 
 
 
275 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  47.97 
 
 
274 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  46.86 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  45.19 
 
 
271 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.07 
 
 
372 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  46.21 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.07 
 
 
273 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  44.07 
 
 
273 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  44.07 
 
 
328 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.07 
 
 
328 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  45.56 
 
 
274 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  45.56 
 
 
274 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  45.17 
 
 
274 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  45.45 
 
 
274 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  42.38 
 
 
270 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
282 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 
285 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  43.13 
 
 
270 aa  195  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  44.92 
 
 
238 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 
267 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 
297 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
273 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  30.71 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  29.32 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
276 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
265 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
265 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  31.92 
 
 
263 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.65 
 
 
283 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
270 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
271 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
264 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  26.15 
 
 
264 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  29.6 
 
 
264 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
264 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.8 
 
 
261 aa  99  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.08 
 
 
425 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
265 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 
267 aa  95.5  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
264 aa  95.5  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.6 
 
 
259 aa  92.8  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.96 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.41 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
333 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
258 aa  89.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.71 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.86 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.31 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.86 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.86 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
291 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
270 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
291 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  27.99 
 
 
263 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.26 
 
 
265 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
291 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.01 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  28.05 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  28.05 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  28.05 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  28.05 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.64 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>