More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1812 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
297 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  43.92 
 
 
282 aa  261  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 
276 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
276 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
280 aa  209  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 
276 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
276 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  37.84 
 
 
277 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 
276 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 
278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
276 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
284 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 
277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  35.76 
 
 
270 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  32.53 
 
 
275 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  32.87 
 
 
271 aa  178  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
275 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
270 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.38 
 
 
372 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  29.45 
 
 
328 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  29.45 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.45 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.45 
 
 
328 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30 
 
 
274 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
274 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  31.79 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  29.07 
 
 
271 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
285 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.53 
 
 
238 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
275 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.13 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
264 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
273 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25.8 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  24.49 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  23.69 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.48 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  26.61 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  26.61 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.28 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.94 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  37.72 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.53 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  20.96 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  21.25 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  22.26 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  23.88 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  22.11 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  24.72 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  21.43 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  22.41 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  22.07 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.41 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  21.53 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  21.55 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  25.43 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  21.12 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  22.42 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  23.69 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  22.22 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  25.43 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  21.75 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  22.38 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  22.44 
 
 
270 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.89 
 
 
257 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  21.07 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.89 
 
 
257 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>