More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4521 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 270 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.66 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.47 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  31.37 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.17 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.15 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.15 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  29.85 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.12 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  30.77 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.96 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  30.74 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 259 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 286 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  30.95 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  30.61 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  31.78 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  28.62 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  28.62 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  28.62 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  28.62 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  25.66 
 
 		 262 aa  89  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  30.19 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 276 aa  88.6  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.78 
 
 		 328 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  28.99 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  28.35 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 		 393 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  29.3 
 
 		 380 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  29.74 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  31.13 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.85 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  27.34 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  31.4 
 
 		 328 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.27 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  31.85 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.4 
 
 		 372 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.85 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.27 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.06 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.27 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.6 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.29 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  28.3 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>