More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2565 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  71.48 
 
 		 290 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  69.26 
 
 		 291 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  66.06 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  66.06 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  66.06 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  67.27 
 
 		 295 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  52.17 
 
 		 350 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  51.06 
 
 		 361 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  51.93 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  47.86 
 
 		 301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  47.96 
 
 		 333 aa  244  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  47.02 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  47.54 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  45.85 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  45.85 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  45.85 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 		 340 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  45.45 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  45.55 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  41.36 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  34.66 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.84 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.83 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.49 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.36 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.83 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.18 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.83 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.77 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.83 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.83 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  28.46 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.46 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  28.84 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 504 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.43 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 339 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 312 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.41 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.06 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.43 
 
 		 369 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.07 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.55 
 
 		 312 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.92 
 
 		 371 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.92 
 
 		 371 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.92 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>