More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1992 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 314 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  58.05 
 
 		 333 aa  342  5.999999999999999e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 		 350 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  51.66 
 
 		 361 aa  311  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  52.7 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  50.49 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  52.88 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  52.88 
 
 		 340 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  52.88 
 
 		 340 aa  299  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  50.5 
 
 		 340 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  50.85 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  48.83 
 
 		 301 aa  279  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  48.6 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  48.47 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  43.66 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  43.17 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  43.32 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  43.32 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  43.32 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  44.01 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  40.36 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 275 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.4 
 
 		 371 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 291 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 291 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 281 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.47 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 		 299 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.39 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.1 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  32.13 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.8 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  31.11 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.06 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  25.44 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.29 
 
 		 369 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 266 aa  99  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.26 
 
 		 285 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.36 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  31.11 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.21 
 
 		 462 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.17 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 289 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  25.09 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.02 
 
 		 370 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  27.44 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  27.44 
 
 		 291 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.44 
 
 		 291 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  27.44 
 
 		 291 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  26.04 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  27.17 
 
 		 291 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 278 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.2 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  24.73 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>