More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0475 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
290 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
339 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.18 
 
 
370 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.03 
 
 
380 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.16 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
287 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.6 
 
 
370 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
333 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.47 
 
 
371 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.1 
 
 
371 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.1 
 
 
371 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31 
 
 
370 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.73 
 
 
371 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.18 
 
 
372 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.13 
 
 
367 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.88 
 
 
370 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
312 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.5 
 
 
368 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
291 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
291 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
291 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
291 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
314 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.39 
 
 
368 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
296 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.22 
 
 
370 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.51 
 
 
313 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.39 
 
 
368 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 
290 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
315 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
295 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.62 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 
350 aa  96.3  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.73 
 
 
371 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
340 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.77 
 
 
370 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.47 
 
 
371 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.37 
 
 
374 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 
284 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 
308 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.32 
 
 
371 aa  92.8  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
257 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.37 
 
 
371 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.73 
 
 
341 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
299 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
316 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.15 
 
 
372 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.17 
 
 
462 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.78 
 
 
369 aa  89  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
366 aa  89  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
315 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  27.95 
 
 
462 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
280 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
273 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
292 aa  85.9  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  31.23 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  30.53 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.9 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.55 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.5 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  24.19 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>