More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1837 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  92.99 
 
 
371 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  98.11 
 
 
371 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  96.5 
 
 
371 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  93.53 
 
 
371 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 
371 aa  739    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  93.8 
 
 
371 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 
371 aa  739    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  76.49 
 
 
370 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  73.51 
 
 
370 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  73.78 
 
 
370 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  61.31 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  59.78 
 
 
368 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  60.33 
 
 
368 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  60.05 
 
 
368 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  58.42 
 
 
370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  57.77 
 
 
370 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.54 
 
 
369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.05 
 
 
374 aa  339  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.96 
 
 
372 aa  339  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.09 
 
 
372 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.65 
 
 
371 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50 
 
 
367 aa  332  9e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.38 
 
 
370 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.84 
 
 
380 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.67 
 
 
389 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.57 
 
 
443 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2228  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.22 
 
 
440 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.58 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
290 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 
273 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1572  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.4 
 
 
461 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0317  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  51.61 
 
 
99 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  51.11 
 
 
450 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 
296 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
277 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
291 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
291 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
291 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
309 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
290 aa  96.3  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
284 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
286 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
274 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
288 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  29.27 
 
 
286 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1026  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  47.01 
 
 
450 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138637  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  32.1 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
278 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 
286 aa  92.8  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
299 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
299 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
299 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
361 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
289 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 
264 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
294 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.57 
 
 
277 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
278 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
312 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.99 
 
 
343 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
268 aa  89.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
293 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
276 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  30.42 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
298 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
314 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  32.94 
 
 
275 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
265 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
246 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.23 
 
 
288 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
287 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
283 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.44 
 
 
437 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
283 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.19 
 
 
312 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
287 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
288 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
301 aa  86.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
295 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
287 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
299 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
287 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  30.39 
 
 
289 aa  86.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>