More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4043 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 
372 aa  742    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  63.34 
 
 
372 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  57.81 
 
 
367 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  55.31 
 
 
371 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  53.97 
 
 
370 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  52.02 
 
 
370 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.09 
 
 
370 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.67 
 
 
370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.94 
 
 
370 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.63 
 
 
371 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.08 
 
 
370 aa  338  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.13 
 
 
369 aa  335  7.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  52.02 
 
 
371 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 
370 aa  328  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 
368 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.21 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.21 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 
368 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.21 
 
 
371 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.82 
 
 
371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.82 
 
 
371 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.24 
 
 
374 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.8 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.99 
 
 
389 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.97 
 
 
443 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2228  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.58 
 
 
440 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  60.82 
 
 
450 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 
288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
314 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
288 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.67 
 
 
437 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  31.49 
 
 
291 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  32.94 
 
 
279 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
290 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
294 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.46 
 
 
398 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 
288 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  31.92 
 
 
273 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
299 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
299 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
299 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 
255 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
295 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
283 aa  99.8  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
275 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
276 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1026  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  50.43 
 
 
450 aa  97.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
274 aa  97.1  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
302 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
287 aa  97.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 
289 aa  96.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
284 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
289 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
291 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
271 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
279 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
288 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
286 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
312 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  32.08 
 
 
276 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
284 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
278 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
254 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.68 
 
 
260 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 
272 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.43 
 
 
288 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
283 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
310 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
279 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1572  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.29 
 
 
461 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
273 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
315 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
278 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
290 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
279 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
316 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
299 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.85 
 
 
278 aa  89.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
289 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
272 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.04 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  29.04 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  30.49 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>