More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2405 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 		 369 aa  725    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  53.68 
 
 		 370 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  55.28 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  52.32 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.63 
 
 		 371 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.82 
 
 		 370 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.23 
 
 		 368 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.63 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 		 370 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.5 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.21 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.63 
 
 		 371 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.63 
 
 		 371 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.5 
 
 		 368 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.39 
 
 		 372 aa  345  7e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.6 
 
 		 372 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 		 367 aa  338  7e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.09 
 
 		 371 aa  332  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.82 
 
 		 380 aa  330  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.69 
 
 		 370 aa  328  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.54 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.54 
 
 		 371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.18 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2228  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.82 
 
 		 440 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.79 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 290 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1026  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  50.44 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 290 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 288 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  56.18 
 
 		 450 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.87 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 293 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 291 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 299 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 287 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 314 aa  99.8  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 299 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 299 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 299 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 299 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 299 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 299 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1572  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.55 
 
 		 461 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  31.09 
 
 		 315 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  31.09 
 
 		 315 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  33.73 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0317  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.39 
 
 		 99 aa  97.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137506  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  33.75 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 285 aa  96.3  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  30.83 
 
 		 291 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  32.46 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 274 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 288 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 		 277 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 277 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 283 aa  92.8  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 		 279 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 274 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 273 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 295 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 311 aa  89.7  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 278 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 276 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  32.6 
 
 		 276 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 320 aa  87.8  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 304 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>