More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25910 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  100 
 
 
315 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  99.68 
 
 
315 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  63.67 
 
 
309 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
292 aa  212  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 
311 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 
311 aa  206  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
315 aa  195  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 
312 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  37.83 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
339 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0109  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
296 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
346 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
290 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
308 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
275 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
288 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
284 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  26.73 
 
 
290 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.52 
 
 
291 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 
291 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 
291 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  26.52 
 
 
291 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  26.52 
 
 
291 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  27.48 
 
 
290 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  26.13 
 
 
291 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  28.62 
 
 
312 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.68 
 
 
370 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.2 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
312 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
275 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 
327 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  26.03 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.15 
 
 
369 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
299 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
283 aa  96.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
504 aa  95.9  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  32.83 
 
 
276 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  26.77 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  29.06 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
316 aa  95.9  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
329 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.38 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.54 
 
 
371 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  25.08 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  25.08 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  25.08 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  25.08 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.26 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  25.71 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  25.4 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  24.51 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 
289 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.24 
 
 
380 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.72 
 
 
277 aa  92.8  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17861  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.2 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
294 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
290 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
290 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  24.59 
 
 
287 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.56 
 
 
313 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
344 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.02 
 
 
313 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
387 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.53 
 
 
368 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
291 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
291 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30 
 
 
367 aa  89.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
291 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
333 aa  89.4  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
300 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
295 aa  89  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.53 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  25.44 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.53 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>