More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1039 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
277 aa  551  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  34.22 
 
 
267 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 
267 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 
263 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 
265 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
266 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 
268 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
275 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 
285 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  29.48 
 
 
277 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  33.74 
 
 
278 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
284 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
265 aa  115  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.18 
 
 
262 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
267 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
259 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.46 
 
 
308 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 
264 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.01 
 
 
282 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 
265 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
263 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  35.42 
 
 
261 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  33.46 
 
 
262 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  35 
 
 
279 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
226 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 
270 aa  99  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  36.9 
 
 
265 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 
264 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  31.23 
 
 
263 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  33.21 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  34.82 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.73 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  36.14 
 
 
360 aa  95.5  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
270 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.18 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  31.6 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  30.83 
 
 
262 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
262 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 
263 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 
393 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  30.96 
 
 
271 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  34.17 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.17 
 
 
270 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  34.68 
 
 
396 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  34.21 
 
 
254 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  37.13 
 
 
391 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.05 
 
 
264 aa  92  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  30.43 
 
 
263 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  30.99 
 
 
275 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  32.24 
 
 
259 aa  92  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  35.14 
 
 
265 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  29.26 
 
 
283 aa  92  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.75 
 
 
261 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  34.06 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
275 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
257 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.13 
 
 
425 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.2 
 
 
369 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  30.52 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  32.27 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  30.31 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  31.18 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  35.42 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
361 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
279 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
301 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
266 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.88 
 
 
295 aa  89  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  34.78 
 
 
386 aa  89  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 
268 aa  89  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  31.69 
 
 
266 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
276 aa  89  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  31.69 
 
 
261 aa  88.6  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.1 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>